Teori Naruto menceritakan Akatsuki sebagai kelompok misterius yang diketahui hanya melakukan tindakan kejahatan.
Meskipun dengan banyak anggota, ternyata dipercayai oleh para penggemar bahwasanya setiap anggota memiliki motivasi dalam mengikuti perang di dunia nyata.
Pain dan Konan bersedia dalam menciptakan kedamaian abadi dengan cara pertumpahan darah. Hidan juga melakukan pembunuhan dengan atas nama agama.
Itachi pergi untuk berperang dan melindungi negara serta orang-orang yang disayangi. Kisame dan Kakuzu menggunakan tipu daya terhadap pemerintah untuk kepentingan pribadinya.
Deidara dan Sasori memiliki harapan supaya dikenal menjadi pelopor diplomatik baru. Madara dan Tobi ingin membuat satu negara kesatuan dalam kedamaian abadi sesuai keinginannya.
Zetsu juga ada guna mengembalikan kejayaan di masa lalu yakni adanya klan Otsutsuki di Bumi.