Cerita game ini berlangsung di Kivotos, sebuah kota akademi yang terdiri dari berbagai distrik dan dianggap mandiri.
Namun, kemampuan dari Majelis Mahasiswa Umum sebagai dewan pengurus telah terhenti sejak menghilangnya secara misterius presiden mereka.
Hal ini menyebabkan munculnya banyak masalah di kota Kivotos.
Untuk mengatasi masalah ini, Majelis Mahasiswa Umum meminta bantuan dari Klub Investigasi Federal, atau Schale.
Schale merupakan klub terbaru di kota tersebut, dan klub terakhir yang disetujui sebelum kepergian presiden.
Untuk menyelesaikan tugas mereka, Schale harus mengandalkan bimbingan seorang Sensei yang dapat membantu mereka menyelesaikan berbagai insiden di sekitar Kivotos.